Cmentarz żydowski w Mikołajkach – kirkut powstał w 1881 i znajduje się przy ul. Dybowskiej. Ma powierzchnię 0,06 ha. Jest jedną z nielicznych zachowanych nekropolii żydowskich na Mazurach. Do naszych czasów zachowało się kilkadziesiąt nagrobków z napisami w języku hebrajskim i niemieckim.
Kościół ewangelicko-augsburski Świętej Trójcy– kościół należący do diecezji mazurskiej Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w RP. Jeden z rejestrowanych zabytków miasta.
Kościół Matki Bożej Różańcowej – rzymskokatolicki kościół parafialny należący do dekanatu Mikołajki diecezji ełckiej. Mieści się przy ulicy Michała Kajki.
Parafia św. Mikołaja w Mikołajkach – parafia rzymskokatolicka w dekanacie Mikołajki, diecezja ełcka.
Została kanonicznie erygowana 1 lipca 1990 przez biskupa warmińskiego Edmunda Piszcza.
Muzeum Reformacji Polskiej w Mikołajkach – pierwsze w Polsce muzeum poświęcone w całości historii reformacji polskiej, ze szczególnym uwzględnieniem Mazur.
Łuknajno lub Łuknajny – jezioro położone ok. 5 km od Mikołajek, w województwie warmińsko-mazurskim, w Krainie Wielkich Jezior Mazurskich. Jest jedną z najważniejszych europejskich ostoi ptactwa wodnego.