Muzeum Erotyki w Warszawie – jedyne w Polsce (prywatne, działające od 2011) i jedno z nielicznych w Europie skupiające erotyczne przedmioty ze wszystkich kontynentów. Zlokalizowane w okolicach Ogrodu Saskiego w Warszawie. Zamknięte w styczniu 2012.
Muzeum Historii Polski w Warszawie – muzeum, którego zadaniem jest zaprezentowanie najważniejszych wydarzeń polskiej historii, ze szczególnym uwzględnieniem polskich tradycji wolnościowych.
Muzeum Historyczne m.st. Warszawy – muzeum gromadzące i prezentujące zbiory związane z historią Warszawy, mieści się w jedenastu kamienicach przy Rynku Starego Miasta i ul. Nowomiejskiej.
Muzeum Harcerstwa – instytucja muzealna z siedzibą w Warszawie, jednostka organizacyjna o charakterze naukowo-badawczym i kulturalno-oświatowym, powołana i prowadzona przez Związek Harcerstwa Polskiego. Muzeum zostało utworzone w dniu 6 czerwca 2001 roku przez Naczelnika ZHP hm.
Muzeum Adwokatury Polskiej przy Naczelnej Radzie Adwokackiej – muzeum znajdujące się w Warszawie przy ul. Świętojerskiej 16 gromadzące zbiory dotyczące historii zawodu adwokata w Polsce od końca XVIII wieku.
Muzeum Historii Żydów Polskich (MHŻP) – placówka muzealna poświęcona historii i kulturze polskich Żydów, której siedziba znajduje się na warszawskim Muranowie przy ul. Anielewicza 6 obok pomnika Bohaterów Getta w Warszawie.
Muzeum Historii Spółdzielczości w Polsce – warszawskie muzeum powstałe w roku 2001, działające przy Krajowej Rady Spółdzielczej. Mieści się na czwartym piętrze Domu pod Orłami.
Muzeum Politchniki Warszawskiej - muzeum akademickie w Warszawie zajmujące się historią Politechniki Warszawskiej, gromadzące wykorzystywaną na uczelni aparaturę naukową i badawczą oraz dokumenty, fotografie i pocztówki.
Muzeum Więzienia "Pawiak" – muzeum stanowiące upamiętnienie więzienia Pawiak, działającego w latach okupacji niemieckiej 1939-1944. Jest oddziałem Muzeum Niepodległości. Zostało otwarte zostało 28 listopada 1965 roku. Jego filią jest Mauzoleum Walki i Męczeństwa w al. Szucha 25.
Muzeum Geologiczne Państwowego Instytutu Geologicznego – muzeum mieszczące się w budynku Państwowego Instytutu Geologicznego w Warszawie
Muzeum powstało w 1919 roku. Obecnie mieści się w zabytkowym gmachu wybudowanym w latach 1925–1930 według projektu architekta Mariana Lalewicza.
Muzeum i Instytut Zoologii PAN – geneza muzeum sięga Gabinetu Zoologicznego powstałego w 1819 przy ówczesnym Królewskim Uniwersytecie Warszawskim i rozwijającego się do 1862 pod kierownictwem Feliksa Pawła Jarockiego.
Muzeum Archidiecezji Warszawskiej - muzeum kościelne w Warszawie prezentujące zbiory sztuki sakralnej. W zbiorach muzeum znajduje się ponad 20 tysięcy eksponatów w tym: malarstwo, grafiki, rzeźby, tkaniny, numizmaty, medalierstwo, złotnictwo.
Muzeum Ikon w Warszawie – muzeum ikon otwarte w 2011 w Warszawie na Ochocie przy ul. Lelechowskiej 5 w starej kotłowni. Znajduje się tu także punkt duszpasterski św. Męczennika Archimandryty Grzegorza oraz – działająca od 18 października 2012 – Akademia Ikony.
Muzeum Powstania Warszawskiego – muzeum historyczne w Warszawie, samorządowa instytucja kultury m.st. Warszawy, założone w 1983 jako Muzeum i Archiwum Powstania Warszawskiego. Zostało otwarte w 2004 i wpisane do Państwowego Rejestru Muzeów (nr 81) w 2005.
Szkoła Podchorążych w Warszawie – wyższa szkoła wojskowa powstała 28 lipca 1815 roku w Warszawie szkoląca przyszłych oficerów. Jej siedziba mieściła się w Wielkiej Oficynie w Łazienkach Królewskich w Ujazdowie. Dzisiaj jest tam muzeum (tzw. Podchorążówka).
Centrum Nauki Kopernik – centrum nauki założone w 2005 w Warszawie, którego celem jest promowanie i popularyzacja nowoczesnej komunikacji naukowej. Zwiedzający mogą poznawać prawa przyrody poprzez samodzielne przeprowadzanie doświadczeń na interaktywnych wystawach.
Muzeum Warszawskiej Pragi, Muzeum Pragi – muzeum w Warszawie poświęcone Pradze – prawobrzeżnej części miasta – i jej dziedzictwu.
Formalnie Muzeum Warszawskiej Pragi zostało powołane uchwałą Rady Warszawy w 2006 i jest oddziałem Muzeum Historycznego m.st. Warszawy.
Muzeum Gazownictwa – muzeum w dzielnicy Wola w Warszawie, przy ul. Kasprzaka 25.
Placówka znajduje się na terenie Gazowni Warszawskiej, w dawnym budynku aparatowni i tłoczni gazu, która wiele lat temu służyła sprężaniu gazu i przesyłaniu go kolektorami do odbiorców.
Neon Muzeum - muzeum w Warszawie zajmujące się dokumentacją i ochroną polskich reklam świetlnych powstałych w okresie po II wojnie światowej. Jest pierwszym w Polsce i jednym z nielicznych muzeów neonów na świecie.
Muzeum Teatralne w Warszawie – centralne muzeum teatralne w Polsce, gromadzące zbiory związane z historią teatru polskiego, jak i teatrów zagranicznych.
